云计算助力农业育种：农科院携三方共推“云之稻”公益项目

中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司共同推动“云之稻项目”，对外分享3000份绿色稻基因组原始测序数据。这项研究将有助于发掘水稻优良基因，突破水稻复杂性状分子改良的技术瓶颈，加快高产、优质、广适性新品种培育的进程。

各合作方基于公益的目的，不仅提供数据下载和共享平台，而且提供相应的变异分析流程和工具。聚道科技的数据分析处理技术结合阿里云所提供的计算存储能力和多种产品搭建起了平台，通过承载由华智和农科院所提供的共享数据和分析工作流，用户不仅可以下载数据，而且可以直接在云端对3000份水稻核心种质基因组数据进行分析挖掘。

项目总体目标是培育能够广泛适用于灌溉和雨养地区生态环境，并具有氮磷高效利用、抗病、抗虫、高产、优质、抗逆（干旱、盐碱）等特性的水稻新品种，推动杂交稻种子的生产能力，并为撒哈拉以南非洲国家、亚洲和中国的西南地区水稻分子育种建立一个水稻基因型分析技术台。在后基因组时代，项目还将结合功能基因组学新的方法和策略进行生物育种，这对粮食安全，食品健康发展也是有益的。

对于基因组大数据分析方面，华智水稻提供了一些常用的分析工具和数据分析流程，包括对测序整体质量的检查，与水稻粳稻和籼稻参考基因组的比对，以及对基因组变异位点的鉴定等，通过使用这些工具可以免费调用阿里云的计算资源。

对于基因大数据分析处理中所遇到海量数据的传输、数据的安全和权限隔离、计算任务的调度和处理、稳定且低成本的存储和计算资源等问题，可以利用聚道科技开发的GeneDock基因数据云服务平台解决。聚道针对基因的不同数据格式使用新压缩算法，大大降低了数据存储和传输的成本；针对复杂的基因数据分析工作流，研发了分布式调度和执行引擎，提高了任务运行速度，使运行成本进一步降低。

综上所述，“云之稻项目”既为水稻育种工作提供了数据信息，也为今后基因大数据资源的利用开创了一种全新的模式。