基因测序应用公司「希望组」完成近亿元 B 轮融资,将发力三代测序技术产品化应用

yanyan.·2018-07-02 22:26
关于基因测序,最出名的例子便是安吉丽娜·朱莉曾采用基因测序,为了抵御癌症的侵袭,预防性地切除自己的乳腺。

36氪获悉,北京希望组(以下简称“希望组”)近日完成了近 1 亿元人民币B轮融资。本轮融资由远毅资本领投,昌平科技产业母基金(昌发展管理基金)和老股东经纬中国跟投。浩悦资本担任本次交易独家财务顾问。2016 年底,团队完成了由经纬中国主领投、赛富投资共领投、清科创投跟投的 A 轮融资。

此轮融资之后,希望组将加大平台和研发的投入,推进三代测序技术在遗传病领域的临床应用落地以及加强与上游企业合作,将三代测序技术和临床应用产品化。

基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性。近年间,基因测序从实验室走入临床,国际上最著名的例子便是安吉丽娜·朱莉曾采用基因测序,并为了抵御癌症的侵袭,预防性地切除自己的乳腺。其余的常见应用场景,便是唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。

从 2015 年开始,希望组在三代测序技术应用于遗传病检测、肿瘤诊断、辅助生殖、微生物组等领域进行了研发和知识产权积累,进而为全球科研及临床用户提供基因组学解决方案的产品和服务。

沃森和克里克在1953年建立DNA双螺旋结构以来,整个测序技术的发展历程。图源:CSDN

以 PacBio 公司的 SMRT 和 Oxford Nanopore Technologies 纳米孔单分子测序技术,被称之为第三代测序技术。与前两代相比,他们最大的特点就是单分子测序,测序过程无需进行PCR扩增。具体来讲,相对于二代,三代测序的优势主要在于:

  • 其读长可达到二代测序的100倍以上,且无CG偏好的优势,甚至可以直接检测DNA/RNA上的碱基修饰。

  • 随着PacBio 和ONT技术平台的发展,以及相应配套生物信息分析水平的提升,已经有效克服了单次读序错误率的问题,在单碱基变异(SNVs)、结构变异(SVs)、甲基化修饰(Methylation)等领域,已经可以广泛应用。

  • 随着 ONT 最新测序仪 PromethION 的推出,测序成本较目前出现指数级的降低,测序通量将呈1000 倍以上的比例增长。

希望组医学科研业务线负责人、市场部副总余国亮告诉36氪,二代测序技术目前的市场占额大概在 80% 左右,他提到,虽然就目前来看,第二代短读长测序技术在全球测序市场上占有绝对的优势,但随着上游公司测序仪的升级,预计在未来的 1 年(甚至更短的时间内)三代测序的价格有望与二代的价格相当,甚至便宜1/2,因此,三代技术能够被迅速推广。

而作为一个新技术,第三代测序的不足之处在于:

  1. 单读长的错误率依然偏高,第三代基因测序技术目前的错误率在15%-40%,极大地高于二代测序技术NGS的错误率(低于1%)。这也成为限制其商业应用开展的原因之一。

  2. 三代测序技术依赖DNA聚合酶的活性。

  3. 成本较高,二代Illumina的测序成本是每100万个碱基0.05-0.15美元,三代测序成本是每100万个碱基0.33-1.00美元。

  4. 生信分析软件也不够丰富。

对于以上几点,希望组王凯教授课题组开发了 NanoMod,通过分析原始信号中的强度特征,改善DNA修饰检测的分析,从而提高碱基修饰信息识别的准确度。而在此之前,王凯已开发一系列二代数据分析软件,包括Annovar ,Phenolyzer,Intervar等,其中,Annovar已经成为二代数据注释方面的行业标准之一。

现阶段,测序的数据源主要来源于医院。

希望组集团拥有“未来组”(基地在武汉)和“希望组”(北京)两大品牌,分别面向科研和临床用户。

余国亮表示,在收入增长方面,科研的收入占比更大。这与医学科研的需求分不开,医生作为主要客户群体以申报项目的方式采购未来组的产品,希望使用二代测序无法解释的疑难病例可以用三代测序做到。而临床方面,三代测序的主要客户为各地的三甲医院,大部分产品均为基于临床遗传病的检测。

谈及市场竞争自然躲不开华大基因。余国亮提到,华大作为全平台的公司,三代测序只是其中很小的一部分。而希望组的竞争力在于专注于三代测序,细分领域相比华大更有优势,而其应用场景也比较丰富,除了基因的检测,生信的研发,还有实验的研发与优化。

此外,余国良告诉36氪,希望组目前配备了 20 台 GridION X5、1台 PromethION、6 台PacBio Seque l以及 2 台 Bionano Saphyr平台,是全球为数不多的配置完整三代测序技术平台的公司,同时也是目前中国独家、世界第一批通过 ONT PromethION 官方测序服务认证的公司。

除了华大基因外,目前国内布局三代测序的还有瀚海基因。2015 年,瀚海基因(Direct Genomics)公布了基于 Helicos 技术研发的专门用于临床的第三代单分子测序仪 GenoCare 原理样机。中科院北京基因组研究所与浪潮基因组科学也在共同研制国产第三代基因测序仪。

团队方面。创始人汪德鹏 1997 年从北京大学生物科学学院毕业,历经基因测序行业17年,2014 年与王凯教授一起创立北京希望组,希望组目前的团队组成 180 余人(北京希望组团队 80 多人,武汉未来组100多人)

文中部分专业知识来源于https://blog.csdn.net/dyllove98/article/details/9736441;

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我是36氪记者yanyan, 关注医疗领域,交流请加微信roseisnotred.

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